南京医科大学是国家“双一流”建设高校，首批教育部、国家卫生健康委与江苏省人民政府共建医学院校，江苏高水平大学建设高峰计划A类建设高校。学校创建于1934年，时名江苏省立医政学院，抗战时期更名为国立江苏医学院。1957年，由镇江迁至南京，更名为南京医学院。1962年，被列为全国首批六年制医药院校。1981年，被批准为全国首批博士、硕士学位授予单位。1993年，更名为南京医科大学。

南京医科大学2023届本科生有2361人，其中获得保送研究生资格的学生有297人，南京医科大学2023届保送研究生所占的比例为12.58%。南京医科大学的第一临床医学院2023届本科生有479人，保送研究生有56人，所占的比例为11.69%。南京医科大学的第二临床医学院2023届本科生有257人，保送研究生有43人，所占的比例为16.73%。

南京医科大学的第四临床医学院2023届本科生有113人，保送研究生有17人，所占的比例为15.04%。南京医科大学的儿科学院2023届本科生有136人，保送研究生有15人，所占的比例为11.03%。南京医科大学的公共卫生学院2023届本科生有183人，保送研究生有41人，所占的比例为22.4%。

南京医科大学的护理学院2023届本科生有317人，保送研究生有14人，所占的比例为4.42%。南京医科大学的基础医学院2023届本科生有89人，保送研究生有26人，所占的比例为29.21%。南京医科大学的康复医学院2023届本科生有148人，保送研究生有7人，所占的比例为4.73%。

南京医科大学的口腔医学院2023届本科生有101人，保送研究生有16人，所占的比例为15.84%。南京医科大学的生物医学工程与信息学院2023届本科生有95人，保送研究生有9人，所占的比例为9.47%。南京医科大学的外国语学院2023届本科生有58人，保送研究生有3人，所占的比例为5.17%。

南京医科大学的药学院2023届本科生有176人，保送研究生有24人，所占的比例为13.64%。南京医科大学的医学影像学院2023届本科生有112人，保送研究生有19人，所占的比例为16.96%。南京医科大学的“医政”学院2023届本科生有95人，保送研究生有7人，所占的比例为7.37%。

南京医科大学护理学院的护理学专业2023届本科生有317人，保送研究生有14人，所占的比例为4.42%。南京医科大学口腔医学院的口腔医学专业2023届本科生有101人，保送研究生有16人，所占的比例为15.84%。南京医科大学外国语学院的英语专业2023届本科生有58人，保送研究生有3人，所占的比例为5.17%。

南京医科大学现有一级学科博士学位授权点8个、二级学科博士学位授权点54个、交叉学科博士学位授权点5个、专业博士学位授权点2个；一级学科硕士学位授权点11个、二级学科硕士学位授权点65个；博士后科研流动站6个，学位授权点覆盖医学、理学、工学、管理学、法学、教育学和文学7个学科门类；南京医科大学拥有国家重点学科3个、国家重点（培育）学科1个、国家临床重点专科29个、江苏高校优势学科（三期）6个。