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华中农业大学研究生(华中农业大学研究生院)

华中农业大学研究生,华中农业大学研究生院


责编 | 王一

所有生物都需要把正确的遗传信息(DNA)传递给下一代,但是DNA 不断地受到各种内源和外源因素的损伤。为了维持基因组稳定性,生物进化出复杂而精细的DNA损伤应答机制,包括细胞周期停滞、DNA损伤修复、转录重编程和细胞死亡等四个方面。在动物中,DNA损伤应答机制的缺陷会导致很多疾病,包括绝大部分的癌症。不同于动物,植物需要利用太阳光进行光合作用,也无法躲避各种环境胁迫(如病原菌、干旱、盐碱、高温、低温等)。太阳光中的紫外线会直接造成DNA损伤,环境胁迫会增加体内的活性氧含量从而损伤DNA。因此,植物在进化过程中形成了特殊的DNA损伤应答机制。

在所有DNA损伤类型中,DNA双链断裂是最严重的DNA损伤形式。同源重组修复是精准修复DNA双链断裂的主要机制,也是利用基因组编辑工具(如 CRISPR/Cas9)进行基因打靶的基础。然而,植物的同源重组效率很低,其调控机制也还很不清楚。转录因子SOG1是植物DNA损伤应答的核心蛋白之一,被认为是动物p53的同功能蛋白。p53是被研究最多的蛋白,也是最重要的抑癌蛋白。与p53相比,人们对SOG1还知之甚少。

2022年4月13日,华中农业大学严顺平团队在国际著名期刊PNAS发表了题为“A plant-specific module for homologous recombination repair”的研究论文,揭示了植物特有的调控同源重组修复机制。


在这项研究中,研究者通过正向遗传学筛选到对DNA双链断裂诱导试剂喜树碱高度敏感的拟南芥突变体ddrm1。他们发现DDRM1 编码一个高度保守的植物特有蛋白,含有BRCT结构域和RING结构域,其生物学功能尚无报道。进一步研究发现DDRM1定位于细胞核,具有E3泛素连接酶活性,能够在多个位点泛素化SOG1并提高SOG1的蛋白稳定性。在ddrm1突变体中,同源重组效率都大大下降,表明DDRM1是同源重组所必需的。

该研究发现了植物调控同源重组修复的特有分子模块DDRM1-SOG1。这不仅揭示了植物同源重组修复的新机制,也为利用同源重组修复机制提高基因打靶效率提供了新思路。同时,该研究还首次揭示了植物调控SOG1蛋白稳定性的机制,具有重要的科学意义。


图1. DDRM1是同源重组修复所必需的。A和B,同源重组报告系统的示意图。C和D,GUS染色结果。蓝色信号表示同源重组事件。E和F,同源重组效率的统计图。G,DDRM1作用机理示意图。

华中农业大学严顺平教授为本文的通讯作者,博士后王轩鹏为本文的第一作者。该研究受到国家自然科学基金、华中农业大学自主科技创新基金等项目的资助。

据悉,严顺平教授于2014年回国组建独立实验室,开启了新的研究方向——植物DNA损伤应答机制,并取得了系统性和创新性的研究成果:(1)阐明了植物ATR-WEE1激酶模块激活细胞周期停滞的机制,改变了人们对WEE1作用机制的传统认识;(2)发现了染色体结构维持复合体SMC5/6具有激活细胞周期停滞的新功能,揭示了植物协同调控细胞周期停滞和DNA损伤修复的分子机制;(3)揭示了人们长期寻找的同源重组酶RAD51在减数分裂DNA损伤修复中的真正作用。相关成果以独立通讯作者发表在Nature Plants(2021)、Nucleic Acids Research (2021)、PNAS(2018和2022)等杂志,以共同通讯作者发表在Plant Cell(2021)杂志。

https://www.pnas.org/doi/10.1073/pnas.2202970119

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